大唐咸通十五年（公元874），李唐王朝在完成最后一次迎奉佛祖释迦牟尼指骨舍利时，由于这枚舍利是佛教世界至高无上的圣物，懿、僖宗父子二宗皇帝在惠果——智能轮大阿阇黎的指导下，以数千件绝代珍宝供奉，在法门寺地宫完成了佛教供养的最高结集——佛指舍利供养曼荼罗世界。
梵语曼荼罗，译为坛场，义为轮圆具足，含蕴集精华、辐射光芒之意。据密宗经典记载，法身佛大日如来为十地以上菩萨讲授《大日经》和《金刚顶经》在南天铁塔内外分别传出了胎藏界（物质世界）和金刚界（精神世界）两部大法，于公元七世纪分别为印度高僧善无畏和金刚智所承传。善无畏、金刚智未在印度传授，而率其弟子不空于唐开元年间先后来到中国长安（史称开元三大士）结坛传法并相互传授，是谓“金善互授”，由始两部大法互相交流。其后，善、金又将两部大法使于印度僧人不空和中国僧人一行。由是一人而传承两部大法，谓之“两部一具”。不空尽得两部其谛而全传于中国僧人惠果。。行、惠果为两部一具最当机之大师。一行原系天台学人，侧重胎藏界，其《大日经疏》为胎藏界解释《大日经》之根本论典，无不依为原典，称为大疏，台密以他为创造台密的实际宗祖。特别是为代、德、顺宗皇帝国师的惠果，融汇两部大法侧重于金刚界，其创绘的金刚界曼荼罗与金刚密号等，为金刚界理解《金刚顶经》之根本依据，其内涵多与中国传统文化相结合，创立了继承印密而又别有发展的唐密体系，推动佛教密宗中国化而成为唐密大法，东密公认他为初祖。从青龙寺至大兴善寺智能轮的唐密一系，在日本空海、最澄回日创立东密、台密后，其间虽经唐武宗的会昌法难，但一直传承并发展着。特别是法门寺地宫，以绘画、雕塑结合儒家礼制结坛，供养佛指舍利，聚集为金、胎两部曼荼罗，以辐射遍照，成为唐密的大千世界。这是佛教由小乘、大乘发展到密乘最高阶段，聚集所有佛和菩萨，包含显密全部教相（理论）、事相（实践）的圆满悉地无上成就。李唐王朝先后迎奉佛指舍利“结坛塔下”，就是观想在这个无上法界中获国佑民，弘法利生，为万世开太平。十分可惜，当唐密人法由惠果、一行的日本弟子空海和最澄接承，创立日本东密、台密，发扬光大，迄令传承不绝，而唐密及其后在中国发展到金、胎合曼的全新阶段时，随着法门寺地宫的封门，这座无比庄严辉煌、重重无尽的大千世界一千余年不被人知。
1981年8月24日，法门寺明代真身宝塔半壁坍塌。1987年2月清理塔基，4月3日发现唐代地官，考古工作者进行科学发掘，在地下沉睡了1113年的辉煌灿烂的唐代文化宝藏——佛教世界千百年来梦寐以求的佛祖释迦牟尼指骨舍利以及上千件李唐干朝的供奉物得以面世。这批文物包括：确系唐代诸帝顶礼膜拜的四枚佛祖释迦牟尼指骨舍利（一枚灵骨，二枚影骨），这是目前世界仅存的佛指舍利；属于唐皇室制和内库供奉的一百二十一件（组）金银器，其中唐懿宗、僖宗父于亲自供奉的达百件之多，为我国唐代考古所仅见；首次发现的唐宫秘色瓷系列，为我国陶瓷考古最重要的收获；来自古罗马等地的琉璃器群，是世界琉璃器考古史上空前的重大发现，上千件荟萃唐代丝织工艺的丝（金）织物，其中包括武则天等唐皇帝后金襕绣裙、服饰等均是稀世珍宝，四百多件珠玉宝石及数百件漆木器，还有水晶（玉）棺椁及代表法身佛大日如来、释迦佛最高权威的大金锡杖等，都为绝代珍品。
一九九四年初，我国社科界、佛学界终于完成了对法门寺地宫唐密佛舍利供养曼荼罗的全面破译。现已明确，整个地宫在封闭时，被布置为佛祖真身舍利供养佛教密宗曼荼罗的“无上法界”，自法身佛大日如来将包容宇宙万物的胎藏界和金刚界两部根本大法舒心世后，由印度僧人善无畏、金刚智等人将此二部大法分别传入中国唐都长安。